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在自然行为小鼠中使用1克无线显微镜进行全皮层成像

Nature2026年10月19日 00:00

作者信息 作者注 这些作者贡献相同:张元龙,李昂然,袁乐康,王明瑞,赵伟豪 作者及其所属机构 IDG/麦戈文脑研究所,清华-北京生命科学中心,生命科学学院,膜生物学国家重点实验室,生命科学与人工智能中心,清华大学,北京,中国 张元龙,王震博,周洋煊,高林,朱荣康,田梦怡 & 李昆 北京认知智能重点实验室,IDG/麦戈文脑研究所,脑与认知科学研究所,自动化系,清华大学,北京,中国 张元龙,余涛,吴佳敏 & 戴琼海 未来信息技术学院,复旦大学,上海,中国 李昂然 中关村学院,北京,中国 李昂然 电气与计算机工程系,普林斯顿大学,美国新泽西州普林斯顿市 袁乐康 未来技术学院,东北大学,沈阳,中国 王明瑞 中国人民解放军总医院第六医疗中心耳鼻喉头颈外科,解放军医科大学,北京,中国 赵伟豪,吴宇 & 戴璞 临床医学学院,清华大学,北京,中国 宾阳·藏 作者 张元龙,李昂然,袁乐康,王明瑞,赵伟豪,王震博,宾阳·藏,周洋煊,余涛,高林,吴宇,朱荣康,田梦怡,李昆,吴佳敏,戴璞,戴琼海 通讯作者 如需联系,请联系吴佳敏,戴璞或戴琼海。 补充信息 补充信息(下载PDF) 该文件包括补充说明1-5,补充图1-19,补充表1-4,补充视频1-16的图例以及补充参考文献。 报告摘要(下载PDF) 同行评审文件(下载PDF) 补充视频1(下载MP4) Airscope概述。 Airscope组件工作流程和无线神经元记录。 第一部分:展示了一只自由活动的配备Airscope的小鼠,随后展示了设备组装、LED照明、荧光采集、快速更换电池、电池供电操作、机载SD卡存储以及通过Wi-Fi在计算机上实时预览神经元。 第二部分:使用Airscope获取的代表性神经元成像。比例尺500μm。 第三部分:代表性应用,包括在5平方米开放栖息地中对多只自由互动小鼠进行同时记录,以及在单只小鼠中使用两个Airscope进行双点成像,同时记录皮层和脊髓活动。 补充视频2(下载MP4) 评估Airscope对自由活动行为的影响。 动物在400 × 400 × 300mm3开放场地进行评估,一方面仅带有头条(左侧面板),另一方面佩戴Airscope(右侧面板)。 顶部行:由SAM2Mice处理的典型原始视频帧用于自动动物分割。 底部行:从分割视频中提取的相应运动轨迹。 比例尺:10 cm。 补充视频3(下载MP4) 采用高分辨率3D重建骨架的Airscope神经记录。 左上:佩戴Airscope的小鼠侧面视图视频,由八个周围相机记录。 中上:带有SAM2Mice分割的俯视行为视频。 右上:从多相机视图重建的3D骨架。 左下:去背景的原始钙成像。 中下:使用100帧滑动窗口计算的每帧单神经元连接性,透明度表示连接强度。 右下:大脑区域神经活动的热图,以及来自两个区域的神经元轨迹示例。 比例尺:500μm。 补充视频4(下载MP4) 通过SAM2Mice实现强健的零次分割和身份追踪。 第一部分:在开放场地和食物竞争场景中对多只小鼠进行零次SAM2Mice分割,比较真实标签和SAM2。 第二部分:使用YOLO v11生成的身份提示进行无提示分割,适应于2.3 × 2.3米的栖息地。 第三部分:在不同的行为环境中呈现稳健的零次表现。 第四部分:在连续动物出现中进行动态身份追踪,与DeepLabCut进行比较。 第五部分:对三只和五只小鼠进行多动物分割,与SuperAnimal和DeepLabCut进行比较。 SAM2Mice在拥挤条件下保持稳健的分割和一致的身份。 J&F表示平均Jaccard指数和F-score。 补充视频5(下载MP4) 使用Airscope和SAM2Mice进行同时动物组记录和多动物实例分割。 左上:在60cm圆形场地中自由移动的五只小鼠佩戴Airscope,显示为原始视频和SAM2Mice分割。点表示2秒质心轨迹,突出边界标记近距离社交互动(<2 cm)。 中上:带有2秒轨迹的身份编码分割掩码。 右上:基于掩码质心的3D X-Y-时间轨迹。

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