耶鲁大学主导的一项重大新研究正在填补遗传学研究中的长期空白，提供了迄今为止对大洋洲人类遗传多样性最全面的考察。尽管南太平洋拥有极其多样化的人口，但这一地区的人们在大型遗传研究中历史上一直被低估。大部分基因组学研究集中在欧洲血统的人群上，留下了关于人类历史和生物学的重要问题没有答案。耶鲁大学艺术与科学学院人类学助理教授、耶鲁人类进化基因组实验室首席研究员塞丽娜·图奇说：“大洋洲人群的严重低估限制了我们对人类进化的理解，并可能加剧健康不平等，因为基因组研究被用于开发新的医疗治疗。”为了填补这一空白，我的研究团队开展了一项大规模项目，以扩展对人类遗传变异的知识，包括从已灭绝的古人类那里继承的遗传变异。该研究于6月11日在《科学》杂志上发表，突显了从已灭绝的人类亲属那里继承的DNA如何继续影响现代人类的生物学、健康和生存。大洋洲基因组揭示了古代人类历史。为了进行这项研究，研究人员对来自近大洋洲12个种群的177人进行了基因组测序，该地区位于西南太平洋，包括巴布亚新几内亚、比斯马尔克群岛和所罗门群岛。他们将这些数据与来自全球人口的1,284个先前发表的基因组相结合。通过研究一些最早定居太平洋的人类的遗传历史，他们在这一地区定居至少有45,000年的历史，团队揭示了关于人类进化和适应的新细节。最引人注目的发现之一是，近大洋洲人群的祖先与至少三个与丹尼索瓦人相关的不同群体交配，丹尼索瓦人是从西伯利亚发现的化石遗骸中首次识别出来的已灭绝人类亲属。图奇说：“先前的研究表明，从已灭绝古人类（例如尼安德特人和丹尼索瓦人）那里继承的DNA在现今人类群体的基因组中分散存活。”她补充说：“这个研究已经超越了简单地‘复活’这些DNA，展示了它是如何积极地打开和关闭基因，这改变了游戏。这些DNA不仅是古代联系的残余；它们现在仍然影响我们的生物学。”丹尼索瓦DNA仍然影响人类生物学。研究人员指出，古代人类与丹尼索瓦人的交配遗留了许多今天仍然存在的遗传变异。这些变异中的一些仍在人体内发挥功能作用。为了研究这些变异的影响，团队使用了一种称为“大规模平行报告测定”的先进基因组方法。这种技术使研究人员能够直接测试遗传变异如何影响基因活动。分析确定了3100多种改变基因表达的变异。这些发现提供了迄今为止最强有力的证据，表明适应性丹尼索瓦遗传变异在现代人类中依然生物活跃。许多这些变异与干扰素-伽马信号通路相关，后者是免疫系统的一个关键部分，有助于保护身体免受传染病的侵害。研究的第一作者、耶鲁人类进化基因组实验室人类学系助理研究科学家帕特里克·瑞利说：“来自已灭绝古人类——丹尼索瓦人和尼安德特人的DNA，帮助促进人类适应他们在这个世界区域迁徙时所遇到的多样环境。”他补充道：“病原体是人类进化过程中最强的选择压力之一——影响我们生存能力的环境因素。我们发现证据表明，从丹尼索瓦人那里继承的基因增强了古代人类在近大洋洲面临的病毒和细菌的免疫力。”与免疫和骨骼发育相关的古代基因。研究还发现丹尼索瓦DNA有助于骨骼发育。研究人员在一个名为TRPS1的基因中识别了适应性丹尼索瓦变异。有趣的是，同样的基因在中非雨林狩猎采集者和厄瓜多尔高地人口中经历了强烈的正选择。这一发现表明，进化可以在生活在非常不同地区的不同人群中反复青睐类似的适应性。图奇说：“虽然丹尼索瓦人早在几千年前就消失了，但这项研究证明我们的历史仍然紧密交织。”这项研究的合著者包括耶鲁人类进化基因组实验室的丹尼埃拉·特哈达-马丁内斯、萨曼莎·L·米勒、奥黛丽·贾哈迪、张柳和艾莉莎·波梅尔；耶鲁医学院的斯蒂芬·荣、贾里德·阿克斯、玛格丽特·E·普伦蒂斯和史蒂文·K·瑞利；D·安德鲁·梅里克等。