根据有史以来最大的关于与在河流和湖泊中游泳相关的疾病的对照研究，野外游泳与胃肠道疾病和皮疹风险增加有关。研究发现，匈牙利某些地点的游泳者发展皮肤问题的可能性是其他人的两倍以上，而在与粪便污染有关的高浓度大肠杆菌和其他细菌的水中感染胃肠道疾病的风险显著增加。这些发现引发了关于世界卫生组织（WHO）在公众对水质日益关注和户外游泳热潮中决定不再将大肠杆菌作为淡水游泳场所污染的推荐指标的质疑。研究的领衔者、东安格利亚大学医学教授保罗·亨特表示：“原始指南是在2003年左右发布的，而我正是开发这些指南小组的一员，建议对海水和淡水进行大肠杆菌和肠球菌的监测。“世界卫生组织发布了新的指南，他们基本上说：‘不用担心大肠杆菌，专注于肠球菌。’相当尴尬的是，我们发现肠球菌并不与增加风险相关，但大肠杆菌却是。”这项研究涉及匈牙利两个河流和两个湖泊游泳地点的2368人。参与者被随机分配，或者花10分钟在水中浸泡，至少三次浸入脸部，或者留在岸边不进入水中。在试验过程中，他们对水样进行取样，使研究人员能够估计每个游泳者接触大肠杆菌、肠道肠球菌和体外噬菌体的水平——这些病毒感染细菌并可能表明粪便污染。一周后，研究人员对参与者进行症状询问。约2.1%的游泳者报告了胃肠道疾病，包括腹泻、呕吐或伴随发烧的恶心，而非游泳者的比例为1.9%。虽然单独游泳与胃肠疾病之间没有统计相关性，但在接触高浓度大肠杆菌和体外噬菌体的游泳者中，风险显著增加。皮肤问题定义为皮疹、溃疡或瘙痒，报告发生在2.7%的游泳者和1.3%的非游泳人员中，使得游泳者更容易出现皮肤疾病。亨特表示，他对这些结果在英国的适用性“相当有信心”，尽管研究在匈牙利进行。2006年一项德国的独立研究得出了相似的结果。他补充道：“我们有两个不同的国家得出了基本相同的结果，德国和匈牙利，在许多方面气候也没有太大差异。”所报告的皮肤问题与三项粪便污染指标没有关联，表明其他生物或污染物可能是原因。“进入淡水的人民确实有增加皮肤刺激的风险，”亨特说。“我们不知道是什么导致的。有一种解释是称为蜕肤性皮炎（cercarial dermatitis），其中一种鸟类寄生虫钻入人体皮肤并造成反应。河流和湖泊中的藻类刺激也可能导致这一问题。“但这只是推测：我们所知道的是，皮肤刺激与粪便污染的标志无关。”游泳者中呼吸道、耳朵和眼睛感染的病例也更为常见，但数量太少，研究人员无法得出可靠结论。四个游泳地点都符合试验期间施行的欧盟游泳水标准。研究人员表示，随机化设计提供了比观察性研究更强的证据。然而，他们警告称，结果是基于每个地点的一次试验日，并且一些参与者在研究期间报告了在其他地方游泳。亨特表示，结果支持在淡水监测中保留大肠杆菌，并建议体外噬菌体也可以帮助识别不安全的条件。“我认为有一个非常强的论据认为，大肠杆菌，特别是在淡水而非海水中，应该是标准的一部分，应该是指南的一部分，”他补充道。