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南太平洋黄鳍金枪鱼的染色体水平基因组组装与注释 <italic>(Thunnus alalunga)</italic>

Nature2026年8月12日 00:00

数据描述符 开放获取 发布日期:2026年8月12日 科学数据(2026) 引用本文 我们提供了这篇手稿的未编辑版本,以便尽早接触其发现。在最终出版之前,手稿将经过进一步的编辑。请注意,内容中可能存在影响的错误,并且所有法律声明适用。摘要 Thunnus alalunga 是一种经济重要的远洋物种,广泛分布于亚热带和温带水域。在本研究中,我们通过整合PacBio HiFi和Hi-C测序技术生成了T. alalunga的染色体水平基因组组装。最终组装的基因组跨度约为809.18 Mb,contig N50为33.53 Mb。使用Hi-C数据,99.85%的组装被锚定到24个伪染色体上。BUSCO分析表明完整性高,在基因组组装中检测到99.40%的保守同源基因。总共预测了24,432个编码蛋白质的基因,其中99.74%进行了功能注释。重复序列占235.42 Mb,代表基因组的29.22%。这一高质量基因组为将来在气候变化和日益增加的人类压力背景下,T. alalunga的演化、种群结构和保护研究提供了宝贵的基因组资源。致谢 所有作者感谢中国农业农村部2025年全球重点鱼类资源监测与评估项目的支持。资助 本研究得到了国家自然科学基金(32373132)的资助。作者信息 作者及其隶属关系 上海海洋大学海洋生物资源科学与管理学院,中国上海,201306 陆东启、吴峰、朱江峰、张帆 教育部海洋渔业资源可持续开发重点实验室,中国上海,201306 朱江峰、张帆 作者 陆东启 吴峰 朱江峰 张帆 通讯作者 联系人:张帆。伦理声明 竞争利益 作者声明没有竞争利益。附加信息 出版社声明 Springer Nature在已出版的地图和机构隶属关系方面保持中立。权利与许可 开放获取 本文根据创意共享署名-非商业性-禁止演绎 4.0 国际许可协议进行许可,该协议允许任何非商业用途、共享、分发和以任何媒介或格式复制,只要您给予原作者和来源适当的信用,提供指向创意共享许可的链接,并指出您是否修改了被许可材料。在此许可下,您没有权利分享源自本文或其部分的改编材料。除非在材料的信用行中另有说明,本文中包含的图像或其他第三方材料均包含在本文的创意共享许可内。如果材料未包含在本文的创意共享许可中,并且您打算的使用不被法定法规允许或超出了允许的使用,您需要直接向版权持有者获得许可。要查看本许可证的副本,请访问http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/。重印与许可 关于本文 引用本文 陆东启、吴峰、朱江峰等。南太平洋黄鳍金枪鱼的染色体水平基因组组装与注释(Thunnus alalunga)。科学数据(2026)。https://doi.org/10.1038/s41597-026-08085-3 下载引用 收到:2026年3月17日 接受:2026年8月7日 发布:2026年8月12日 DOI:https://doi.org/10.1038/s41597-026-08085-3

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