返回

文章详情

猴痘病毒复制体的结构和操作原理

Nature2026年9月2日 00:00

自2022年以来,猴痘病毒(MPXV)影响了140多个国家,并导致超过179,000例实验室确诊病例。最近一波感染是由Ib变体引发,证据表明人际传播持续存在并全球扩散。另一种痘病毒是天花病毒,造成了人类历史上最具破坏性的疾病之一,直到其被消灭。痘病毒在宿主细胞的胞质中复制。它们的基因组编码DNA复制和基因表达所需的蛋白质,并具有不完全配对的发夹环连接两个DNA链的倒置末端重复,使其形成持续的多核苷酸链。复制病毒基因组的蛋白质包括DNA聚合酶(F8,A22和E4)和六聚体解螺旋酶-引物酶E5。痘病毒的DNA聚合酶属于B类DNA聚合酶,其催化亚基F8包含经典的指头、掌和拇指结构域、N末端结构域(NTD)和3′–5′校对外切酶(Exo)结构域。F8的外切酶活性还促进了病毒基因重组。在组装的聚合酶全酶中,A22作为桥梁连接F8和E4。病毒解螺旋酶-引物酶E5的N末端区域包含一个引物酶结构域,其酶活性对病毒DNA复制至关重要。E5的C末端区域包含一个超家族3解螺旋酶,并形成一个带有中心通道的六聚体环,用于单链DNA(ssDNA)在3′–5′方向的转运。单链DNA结合蛋白I3对病毒复制也是必不可少的,病毒DNA或宿主DNA连接酶同样重要。之前对全长MPXV E5的研究表明,除非删除引物酶结构域,否则其活性较弱。E5的结构显示引物酶结构域会阻塞E5的ssDNA通道,暗示存在自我抑制的构象。E5如何从自我抑制构象过渡到活化状态尚不清楚。在这里,我们确定了DNA结合的MPXV E5解螺旋酶-引物酶与DNA聚合酶全酶复合体的冷冻电镜(cryo-EM)结构。我们使用生化检测和单分子实验表明,当E5与聚合酶相互作用时,发生的构象变化导致解螺旋酶的激活,并增强了E5的引物酶活性。MPXV复制体的组装我们在短暂转染的哺乳动物细胞中纯化了E5(残基1–785)和聚合酶全酶(F8,残基1–1006;A22,残基1–426;E4,残基1–218)。在使用质量光度法(MP)检查时,聚合酶样本中有相当一部分颗粒与组装的全酶(F8–A22–E4)异源三聚体一致,其预期质量为191 kDa(MP测量为193,标准差为±14.5 kDa)。我们还观察到一个较小的峰,可能代表之前研究中也观察到的F8、A22和E4的自我抑制二聚体。图1:MPXV复制体的冷冻电镜结构。a,MPXV E5、F8、A22和E4的结构域架构。对于E5原体,虚线框表示可能由于灵活性无法解析的区域。CTD,C端结构域;NTD,NH2端结构域;F,指头结构域。b,纯化后用SEC可视化的的MPXV E5与聚合酶和DNA(模板1)复合物的SDS-PAGE分析,使用无染胶系统。星号表示可能代表降解的蛋白质产物或污染物的带。实验重复了三次;展示了一张代表性胶体。c,SEC纯化的E5与聚合酶和DNA(模板1)的MP分析。726 kDa的峰可能代表MPXV复制体;538 kDa的复合物与E5六聚体一致;195 kDa的峰可能对应聚合酶全酶;87 kDa的峰可能对应A22–E4亚复合物;而52 kDa的峰可能是A22单独存在。更多信息请参见补充表1。该实验重复了两次(n = 2);显示了代表性数据。d,e,MPXV复制体与ssDNA结合的复合冷冻电镜图(d)和带状图(e)。整体图的分辨率为4.1 Å;复合图由集中于解螺旋酶(3.8 Å)和与引物域结合的聚合酶(3.5 Å)的图组成,后处理使用了DeepEMhancer。在e中,E5 F ZBM和E5 F RRM的连接显示,但由于密度较差未在最终坐标中存放。f,MPXV复制体与叉状DNA结合的复合冷冻电镜图。整体图的分辨率为6.5 Å;复合图由集中于解螺旋酶(4.5 Å)和与引物结合的聚合酶(4.1 Å)的图组成,后处理使用了DeepEMhancer。聚合酶亚单位的着色与e中一致,E5解螺旋酶结构域以灰色显示。E5形成的六聚体与此一致。

赞助内容

NordVPN Next-gen Antivirus

本站免费、广告极少。如果觉得有帮助,可以请我们喝杯咖啡 —— 任何金额都对持续运营有实际帮助。

请我喝杯咖啡