三项关于疫苗安全性存疑的科学论文，被特朗普政府用于证明美国疫苗政策有争议的变化，近期在过去两个月内被发表这些论文的期刊撤回、撤销或置于调查之中。在某些情况下，这些行动是在科学家首次对这些研究的科学价值提出警告多年后才发生的。作为反疫苗运动领袖的美国卫生部长罗伯特·F·肯尼迪（Robert F. Kennedy Jr.）依赖于两项现在面临审查的研究，在他与他人合著的2023年书中，论证未接种疫苗的儿童比接种疫苗的儿童更健康。美国疾病控制与预防中心（CDC）在改变长期以来认为疫苗不引起自闭症的立场时引用了一项论文，这与科学共识相违背。所有三项论文都被一名反疫苗律师引用，该律师在一个有影响力的联邦疫苗咨询小组前呼吁改变儿童免疫接种计划。目前尚不清楚为何期刊至今未采取行动。曾批评这些论文的科学家表示，这些行动是一个积极的步骤，因为美国各地的公共卫生官员和医生正在报告可通过疫苗预防的疾病（如百日咳和麻疹）的上升。他们认为，这三项研究被反疫苗运动用于在家长中播下怀疑的种子，削弱了公众对拯救生命的疫苗的安全性的信心。阿尔伯塔大学儿科教授卡里娜·托普（Dr. Karina Top）表示：“意图传播疫苗虚假信息的人和组织非常精明，他们恶意使用科学术语，如‘金标准科学’和发布存在缺陷的研究，以赋予他们的说法表面上的可信度并混淆公众。”她认为：“这些论文是糟糕的科学，作者似乎是为了使数据符合他们的假说，即疫苗是有害的。”三项论文共享一个共同主题：疫苗接种儿童的健康问题风险高于未接种儿童。但所有三项都因使用糟糕的方法和分析受到严厉批评。其中一项，《Neil Z Miller》于2021年发表在《毒理学报告》中，指出疫苗与婴儿猝死综合症（SIDS）之间的联系。另一项由米勒与布赖恩·S·霍克（Brian S Hooker）共同撰写，于2020年发表在《Sage Open Medicine》中，表明接种疫苗的儿童比未接种儿童更容易出现发育迟缓和哮喘等特定健康问题。第三项由卡罗琳·M·加拉赫（Carolyn M Gallagher）和梅洛迪·S·古德曼（Melody S Goodman）于2010年发表在《毒理学与环境健康杂志（第一部分）》中，发现在生命的前四周接种乙肝疫苗的男孩更可能被诊断为自闭症。一些参与的四名研究人员表示，他们不同意期刊的决定。卫生与公共服务部（HHS）未回复请求评论的电子邮件。阿伦·西里（Aaron Siri），曾担任肯尼迪的律师，将三项论文作为他受邀发表给联邦疫苗顾问委员会的演讲的证据。在给《卫报》的声明中，他将科学期刊对这些论文的审查比作“定向刺杀”。他还坚称，没有“可获得的证据”表明疫苗是“安全有效”的，声称他的评估依赖于数百篇其他文章、评论和试验文件。肯尼迪与霍克合作撰写了这本书《Vax-Unvax: Let the Science Speak》，后者是现在正在调查的Sage研究的第一作者。该论文是书中第二章的关键支柱，在这一章中，肯尼迪与作者试图表明接种疫苗的儿童的健康问题如哮喘、发育迟缓和胃肠疾病的发生率更高。该书还揭示了论文发表的内幕，指出五本医学期刊在Sage考虑之前直接拒绝了该论文。它还表示，Sage在寻找愿意审查的研究人员时遇到了困难，同行评审过程耗时11个月，进行了多轮修订。肯尼迪与霍克在肯尼迪领导反疫苗组织儿童健康防御时合作多年，霍克现在担任该组织的首席科学官。HHS发言人未回应有关肯尼迪是否会修订其书籍的提问。发表该论文的Sage Open Medicine期刊于5月18日对其附加了关注声明，几周后《卫报》首次询问该期刊于2025年1月收到的详细投诉。这一声明称，该论文正在调查中。投诉是由一名匿名的儿科医生和科学家提交的，他们与《卫报》分享了这些信息，并要求匿名，因为他们称自己过去曾受到骚扰。