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急性髓性白血病的染色质景观与表观遗传异质性

Nature2026年7月8日 00:00

主要的急性髓性白血病(AML)包含一个异质性大的髓系肿瘤群体,其特征为由于血液生成程序失调导致未成熟髓母细胞的不受控制的增殖。在过去的几十年里,先进的基因组研究提供了一个关于主要驱动突变和结构变异的全面清单,这些突变和变异涉及这些失调的程序,促进了对AML分子发病机制和异质性的更好理解。这些最新的知识已被纳入由世界卫生组织(WHO)、国际共识分类(ICC)小组和欧洲白血病网络(ELN)提出的最新AML分类中,这些分类广泛用于分子诊断、风险分层、药物发现和治疗决策,包括分子靶向疗法的选择。然而,累积的证据表明,基因改变并不能完全解释AML的病理生理学和异质性。表观基因组是一种非遗传的细胞遗传机制,通常在癌症中发生广泛的改变,包括异常的DNA甲基化、染色质修饰和高阶染色质结构。实际上,改变的表观基因组是癌症的一个标志,并作为基因突变之外的另一个肿瘤机制层次。频繁的表观遗传调节因子的突变也强调了改变的表观基因组在癌症中的关键作用。然而,癌症表观基因组也可能受到非基因机制的影响,如来源细胞、干细胞衰老、慢性炎症、感染和代谢损伤,突显了改变的表观基因组在AML中的重要性。在之前的研究中,癌症表观基因组主要通过DNA甲基化进行研究,而对改变的染色质关注较少,尽管染色质代表了表观基因组的另一个层次,并与DNA甲基化一起在基因表达调控和分化中起着关键作用。通过整合来自基因和表观遗传成分的调控,染色质可及性提供了关于转录机器的表观遗传调控的信息,包括转录因子结合和基因表达状态,超出了单独从DNA甲基化数据中获得的信息。此外,染色质可及性可以通过简单且可扩展的方法进行评估:ATAC-seq。因此,使用ATAC-seq对染色质可及性的系统性分析是一种适合用于分析大规模患者队列中AML表观基因组的方法,尽管在之前的研究中,其应用大多局限于少数病例。在本研究中,我们揭示了基于大规模ATAC-seq数据和多层次测序数据组合的AML综合染色质景观。我们确定了表观基因组在AML发病机制和异质性中的作用,并研究了其对临床表现和药物敏感性的影响。

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