下一代患者来源的多种癌症模型汇编
文章开放获取 发布于:2026年8月5日 Dina ElHarouni,Mushriq Al-Jazrawe,Seongmin Choi,Merve Dede,Toshinori Hinoue,Sean A. Misek,Heeju Noh,Luca Zanella,Yuen-Yi Tseng,Hayley E. Francies,Dennis Plenker,Cindy W. Kyi,Julyann Perez-Mayoral,Megan J. Stine,Eva Tonsing-Carter,Rachana Agarwal,Jean Claude Zenklusen,James M. Clinton,Jennifer M. Shelton,Timothy R. Chu,William F. Hooper,Xavi Loinaz,Paula Keskula,Jordan Tagle,Peyton C. Kuhlers,Bahar Tercan,Sylvia F. Boj,Alessandro Vasciaveo,Lorenzo Tomassoni,James M. Crawford,Shawna Walsh,Claire Sinai,Sonam Bhatia,Priya Sridevi,Hardik Patel,Maria Antonietta Cerone,HCMI网络,Kyle Ellrott,Calvin J. Kuo,Olivier Elemento,Semir Beyaz,Vincenzo Corbo,David L. Spector,Rameen Beroukhim,Martin L. Ferguson,Andrew D. Cherniack,Peter W. Laird,Nicolas Robine,Andrew McPherson,Katherine A. Hoadley,Mathew J. Garnett,David A. Tuveson,Andrea Califano,Paul T. Spellman,Keith L. Ligon,Daniela S. Gerhard,Louis M. Staudt & Jesse S. Boehm。自然(2026)引用此文章摘要 新疗法的开发和致病性癌症机制的验证需要代表性的实验室模型。然而,现有的模型仅代表人类癌症中观察到的多样性的一小部分。最近的技术使得高效的体外模型衍生成为可能(例如,肿瘤类器官)。然而,这些模型在长期扩增过程中是否保持患者肿瘤的重要特性尚未系统地研究。在这里,我们展示了一个大型国际项目的结果——人类癌症模型倡议——该项目涉及从2780名捐献者生成665个下一代模型,涵盖25种癌症类型,并进行了整合肿瘤-模型的全基因组、外显子组、甲基组和转录组分析。该资源提供522个具有综合临床数据的模型、153个罕见癌症模型和71个来自非欧洲血统参与者的模型。对421对匹配的肿瘤-模型对的分析显示,高遗传(97.8%)和表观遗传(95%)一致性,并定义了模型不一致的相关因素。肿瘤-模型对的单细胞RNA测序揭示了在培养条件显著影响细胞状态的模型子集。最后,我们表征了模型的额外染色体DNA的保存情况及治疗后突变特征,以提供研究治疗耐药性的机会。该模型库正向社区开放,包括多模态分子谱系、临床信息和集成软件工具,从而为癌症发病机制和治疗反应的临床前研究提供宝贵资源。主要国际项目生成的癌症图谱揭示了许多人类恶性肿瘤的分子基础。关于大多数癌症类型的挑衅假说已经出现,每个假说都需要进行临床前验证,以支持基础科学和药物发现。需要经过良好特征描述的癌症模型,以保持多样的人类肿瘤类型和临床状态的保真度,以支持这样的验证。对大量癌症模型进行基因组表征的努力已产生了超过1000个细胞系的全面注释汇编,从而促成了癌症依赖性的规模映射。然而,现有的细胞系通常表现出有限的表型完整性。
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