根据六个知名的人权和媒体自由组织的说法，以色列-黎巴嫩框架协议“威胁背叛黎巴嫩战争罪的受害者”。这六个组织在国际特赦组织、人权观察、黎巴嫩人权中心（CLDH）、法律议程、无国界记者（RSF）以及黎巴嫩记者联盟于周五联合发表的声明中警告说，协议的某些部分“似乎旨在阻止严重国际犯罪的受害者在国际论坛上寻求正义”。这些组织指出，该协议的第3条和第13条令人担忧，因为它们将“阻止黎巴嫩和以色列诉诸国际法院，包括国际刑事法院和国际法院”。这六个组织警告称，“第3条进一步违反国际法和强迫迁移的禁令，将返乡的条件定位在‘对非国家武装集团进行成功的非武装和拆除其基础设施’”。他们的联合声明指出：“根据国际人道法，当敌对行动结束或其驱逐理由不再存在时，人民必须被允许返乡。”这些组织表示，第13条特别令人关切，因为它阻止平民在“国际政治或法律论坛上的行动”。这发生在“数月的敌对行动造成了巨大的平民伤害，包括战争罪、违反国际人道法和严重人权侵犯”。黎巴嫩许多人抗议并批评政府与以色列签署协议。许多批评框架协议的人，正是受到战争影响最大的人，这场战争自今年3月初以来已导致至少4300人死亡，超过12000人受伤，数十万人流离失所。这六个组织表示，美国促成的协议似乎“与各国在其领土上追究严重国际犯罪的国际法律义务相矛盾”，尽管它“似乎并未要求以色列停止在国际论坛上针对真主党的任何举措”。国际特赦组织秘书长阿格尼丝·卡拉马尔（Agnes Callamard）说：“战争罪和其他侵犯行为的受害者应得正义。任何未能以受害者的正义、问责和赔偿权为中心的协议，将因其造成的隐匿而失败。”法律议程的诉讼负责人吉达·弗兰基赫（Ghida Frangieh）补充道：“问责和尊重国际法不是谈判筹码。它们是法律义务。国际法明确表示：国家不能放弃或协商其调查和起诉国际社会整体关注的最严重犯罪的义务。国家也不能消灭个人对真相、正义和赔偿的权利。”但黎巴嫩总统周五表示，与以色列的框架协议“并不合法化以色列对黎巴嫩的持续占领”，相反，它赋权于黎巴嫩军队在全国范围内扩展其权威。约瑟夫·阿翁（Joseph Aoun）在与黎巴嫩大学协会、黎巴嫩医师公会和黎巴嫩马龙派教会代表团会晤时发表了上述言论。阿翁说：“我们将自己的轨道与伊朗-美国轨道分开的主权决定，成为了一些习惯于被控制、为我们决定并代表我们谈判的监护者的问题。”他补充道，黎巴嫩军队将“在以色列部队撤离后，全面承担保障南方安全和稳定的责任”。与此同时，在6月21日作为伊朗和美国达成协议的一部分达成的黎巴嫩“停火”之际，5天后签署的以色列-黎巴嫩框架协议，许多流离失所的黎巴嫩人正在返回南黎巴嫩的家园。在周四发布的一份报告中，国际移民组织（IOM）表示，自6月22日以来，他们与地方当局收集的数据表明，已有646,107名内部流离失所者开始返回他们的社区，而大约500,000人仍然流离失所。黎巴嫩当局表示，他们正在努力清除贝鲁特及周边地区的非正式营地。