连接组模拟识别果蝇行走的中心模式发生器
数据可用性 连接组数据来自于公开可用的数据集,参考文献3、4、5、6。MANC连接组数据是从公共发布(版本1.2.1)中分析的。FANC连接组数据是从CAVE物化(版本1178;时间戳2025-01-07T10:10:01.373080)中分析的。雄性CNS连接组数据是从公共发布(版本0.9)中分析的。BANC连接组数据是从CAVE物化(版本829;时间戳2026-02-13T08:10:01.234098)中分析的。本文所用确切子网络的所有连接性和细胞信息都提供在 https://github.com/smpuglie/Pugliese_2026 。模拟输出数据和Anipose数据可以在Zenodo上找到,链接为 https://doi.org/10.5281/zenodo.22260923 。代码可用性 用于运行连接组模拟的代码以及用于重现每个图中分析的笔记本可在GitHub上找到,链接为 https://github.com/smpuglie/Pugliese_2026 。参考文献 Büschges, A. & Ache, J. M. 运动控制在运动中:从昆虫的见解到一般机制。生理学评论 105, 975–1031 https://doi.org/10.1152/physrev.00009.2024 (2025)。文章 PubMed 谷歌学术 Gosgnach, S. 哺乳动物运动CNS:揭示黑箱的内容。神经生理学 133, 472–478 https://doi.org/10.1152/jn.00238.2024 (2025)。文章 PubMed 谷歌学术 Takemura, S.-Y. 等。雄性果蝇腹部神经索的连接组。预印本在 https://doi.org/10.7554/eLife.97769.1 (2024)。Azevedo, A.等。雌性果蝇腹部神经索的连接组重建。自然 631, 360–368 (2024)。文章 ADS CAS PubMed PubMed Central 谷歌学术 Bates, A. S.等。分布式控制电路跨越脑和脊髓连接组。自然 656, 957–970 (2026)。Berg, S.等。果蝇雄性中枢神经系统的完整连接组中的性别二态性。细胞 189, 5504–5526.e15 (2025)。Sherrington, C. S. 神经系统的整合作用 (耶鲁大学出版社, 1920)。Brown, T. G. 关于神经中心基本活动的本质;以及对进展中节律活动条件作用的分析,以及关于神经系统功能演化的理论。生理学杂志 48 , 18–46 (1914)。文章 CAS PubMed PubMed Central 谷歌学术 Hughes, G. M. & Wiersma, C. A. G. 对虾游泳肢运动协调的研究, Procambarus Clarkii (Girard)。实验生物学杂志 37, 657–670 https://doi.org/10.1242/jeb.37.4.657 (1960)。文章 谷歌学术 Wilson, D. M. 在蝗虫飞行中的中枢神经控制。实验生物学杂志 38, 471–490 https://doi.org/10.1242/jeb.38.2.471 (1961)。文章 谷歌学术 Daur, N., Nadim, F. & Bucher, D. 小电路的复杂性:口腔胃神经系统。神经生物学的当前观点 41 , 1–7 (2016)。文章 CAS PubMed PubMed Central 谷歌学术 Friesen, W. O. & Kristan, W. B. 脊椎动物的系统运动:游泳、爬行和决策。神经生物学的当前观点 17 , 704–711 (2007)。文章 CAS PubMed 谷歌学术 Calabrese, R. L., Norris, B. J. & Wenning, A. 无脊椎动物心跳的神经控制。神经生物学的当前观点 41, 68–77 (2016)。文章 CAS PubMed PubMed Central 谷歌学术 Del Negro, C. A., Funk, G. D. & Feldman, J. L. 呼吸是重要的。自然评论神经科学 19, 351–367 (2018)。文章 PubMed PubMed Central 谷歌学术 Shepherd, G. M., Grillner, S. & Katz, P. S. 在《脑微电路手册》中 (主编 Shepherd, G. M. & Grillner, S.) 561–568 https://doi.org/10.1093/med/9780190636111.003.0051 (牛津大学出版社, 2017)。Calabrese, R. L. & Marder, E. 重要的生成节律运动模式的退化神经元和电路机制。生理学评论 105, 95–135 https://doi.org/10.1152/physrev.00003.2024 (2024)。Lindén, H., Petersen, P. C., Vestergaard, M. & Berg, R. W. 运动由脊髓运动网络中的旋转神经动力学支配。自然 610, 526–531 (2022)。文章 ADS PubMed 谷歌学术 Strohmer, B., Najarro, E., Ausborn, J., Berg, R. W. & Tolu, S. 稀疏放电在脊髓运动电路的混合中心模式发生器中。神经计算 36, 759–780 https://doi.org/10.1162/neco_a_01660 (2024)。文章 谷歌学术 Holmes, P., Full, R. J., Koditschek, D. & Guckenheimer, J. 腿部运动的动力学:模型、分析和挑战。SIAM评论 48, 207–304 (2006)。文章 ADS MathSciNet 谷歌学术 Ijspeert, A. J. & Daley, M. A. 脊椎动物运动的神经机械学中的前馈和反馈控制的整合:实验、模拟和机器人研究的回顾。实验生物学杂志 226, jeb245784 https://doi.org/10.1242/jeb.245784 (2023)。文章 PubMed 谷歌学术 Lesser, E.等。果蝇腿部和翅膀的前运动控制网络的突触结构。自然 631, 369–377 (2024)。Stürner, T.等。果蝇下行和上行神经元的比较连接组学。自然 643, 158–172 (2025)。文章 ADS PubMed PubMed Central 谷歌学术 Marin, E. C.
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