脂肪变性影响CRC中定义预后肝转移异质性
数据可用性 本研究生成的RNA测序数据已存入基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO),其存取号为GSE292820。可公开获取的CRC肝转移RNA测序数据可通过GEO存取号GSE151165获得。OMO-103治疗的患者数据可向相关临床试验负责人(NCT04808362)申请获得。本研究使用的所有其他数据均已在文章及补充信息中公开,合理请求下可由通讯作者获得。本文提供了源数据。代码可用性 本研究未开发任何原创软件和/或算法;然而,数据分析所用的代码可根据请求提供。任何重新分析本文报告数据所需的额外信息可根据请求从通讯作者处获得。参考文献:Kow, A. W. C. 结直肠癌的肝转移。《消化系统肿瘤学》10,1274-1298(2019)。文章PubMed PubMed中央 Google学者;Morgan, E. 等。2020年和2040年结直肠癌的全球负担:GLOBOCAN的发病率和死亡率估计。《肠道》72,338-344(2023)。文章PubMed Google学者;Siegel, R. L., Wagle, N. S. & Jemal, A. 50岁以下人群中主要癌症死亡原因。《美国医学会杂志》335,632-634(2026)。文章PubMed PubMed中央 Google学者;Nielsen, K., Rolff, H. C., Eefsen, R. L. & Vainer, B. 结直肠肝转移的形态生长模式与整体生存期的预后相关。《现代病理学》27,1641-1648(2014)。文章CAS PubMed Google学者;Höppener, D. J. 等。结直肠肝转移的组织病理生长模式与切除后生存的关系:一项外部验证研究。《JNCI癌症谱系》5,pkab026(2021)。文章PubMed PubMed中央 Google学者;Vermeulen, P. B. 等。结直肠腺癌的肝转移以三种模式生长,具有不同的血管生成和纤维化。《病理学杂志》195,336-342(2001)。文章CAS PubMed Google学者;Latacz, E. 等。肝转移的组织病理生长模式:模式评分的更新共识指南、视角和最近的机制洞察。《英国癌症杂志》127,988-1013(2022)。文章PubMed PubMed中央 Google学者;Höppener, D. J. 等。原发性结直肠癌组织学与相应肝转移的组织病理生长模式之间的关系。《BMC癌症》22,911(2022)。文章PubMed PubMed中央 Google学者;van Dam, P.-J. 等。肝转移组织病理生长模式评分的国际共识指南。《英国癌症杂志》117,1427-1441(2017)。文章PubMed PubMed中央 Google学者;Bhattacharjee, S. 等。I型胶原对肿瘤的限制对抗癌相关成纤维细胞的肿瘤促进效应。《临床投资》131,e146987(2021)。文章CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Bocuk, D. 等。结直肠癌细胞在肝脏形成转移时的适应:小鼠模型中相关基因和途径的表达。《BMC癌症》17,342(2017)。文章PubMed PubMed中央 Google学者;Frentzas, S. 等。血管协同作用介导肝转移对抗血管生成疗法的抵抗。《自然医学》22,1294-1302(2016)。文章CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Fleischer, J. R. 等。单细胞分辨率下的血管生成与血管协同作用结直肠癌肝转移的分子差异。《分子癌症》22,17(2023)。文章CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Elia, I. 等。脯氨酸代谢支持转移形成,并可被抑制以选择性靶向转移的癌细胞。《自然通讯》8,15267(2017)。文章ADS PubMed PubMed中央 Google学者;Pilley, S. E. 等。附着力的丧失促进脯氨酸在癌细胞中的积累和排泄。《科学进展》9,eadh2023(2023)。文章CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Westbrook, R. L. 等。通过PYCR1的脯氨酸合成支持癌细胞在低氧条件下的增殖和存活。《细胞报告》38,110320(2022)。文章CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Buescher, J. M. 等。解释细胞中13C代谢物标记模式的路线图。《当前生物技术评论》34,189-201(2015)。文章CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Doglioni, G. 等。天冬氨酸信号驱动肺转移通过替代翻译。《自然》638,244-250(2025)。文章ADS CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Elia, I. 等。乳腺癌细胞依赖环境丙酮酸来塑造转移微环境。《自然》568,117-121(2019)。文章ADS CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Lachmann, A. 等。ChEA:从整合全基因组ChIP-X实验推断的转录因子调控。《生物信息学》26,2438-2444(2010)。文章CAS PubMed PubMed中央 Google学者;Latacz, E. 等。
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