数据可用性 本研究中生成或分析的所有数据均可在论文、其补充信息以及 Zenodo（https://doi.org/10.5281/zenodo.22654831）中找到。晶体结构已经在蛋白质数据库（PDB）中存档（https://www.rcsb.org/），其访问代码为 11CE、11CM、11CP、11CR、11CU、11CY 和 11DU。代码可用性 本研究中使用的代码可在 Zenodo（https://doi.org/10.5281/zenodo.22654831）上获得。参考文献 Studer, S.等. 从短肽中演变出一种高度活跃且特异性很强的金属酶。科学 362，1285–1288（2018）。文章 ADS CAS PubMed Google 学者 Kim, D.等. 金属水解酶的计算设计。自然 649，246–253（2026）。文章 ADS CAS PubMed Google 学者 Bauer, M. S.等. 磷酸酪氨酸肽结合物的设计。预印本于 bioRxiv https://doi.org/10.1101/2025.09.29.678898（2025）。Butcher, J.等. 与 RFdiffusion3 的全原子生物分子相互作用设计。预印本于 bioRxiv https://doi.org/10.1101/2025.09.18.676967（2025）。Radzicka, A. & Richard, W. 中性溶液中未催化肽键水解速率和蛋白酶的过渡态亲和力。美国化学会杂志 118，6105–6109（1996）。文章 ADS CAS Google 学者 Hooper, N. M. 锌金属蛋白酶家族。FEBS 快报 354，1–6（1994）。文章 CAS PubMed Google 学者 Lipscomb, W. N. & Sträter, N. 锌酶学的近期进展。化学评论 96，2375–2434（1996）。文章 CAS PubMed Google 学者 de Almeida, L. G. N.等. 基质金属蛋白酶：从分子机制到生理学、病理生理学和药理学。药理学评论 74，714–770（2022）。文章 Google 学者 Page-McCaw, A., Ewald, A. J. & Werb, Z. 基质金属蛋白酶和组织重塑的调节。自然评论分子细胞生物学 8，221–233（2007）。文章 CAS PubMed PubMed Central Google 学者 Edwards, D. R., Handsley, M. M. & Pennington, C. J. ADAM 金属蛋白酶。医学方面的分子 29，258–289（2008）。文章 CAS PubMed PubMed Central Google 学者 Wang, Z., Li, W., Chen, S. & Tang, X. X. ADAM 和 ADAMTS 蛋白酶在病理性组织重塑中的作用。细胞死亡发现 9，447（2023）。文章 CAS PubMed PubMed Central Google 学者 Iwai, M. & Horiuchi, M. 肾素-血管紧张素系统中的恶魔与天使：ACE-血管紧张素 II-AT1 受体轴与 ACE2-血管紧张素-(1-7)-Mas 受体轴。高血压研究 32，533–536（2009）。文章 CAS PubMed PubMed Central Google 学者 Wang, J., Xu, A., Wan, Y. & Li, Q. 从 Bacillus amyloliquefaciens SYB-001 中纯化和表征一种新的金属中性蛋白酶。应用生物化学与生物技术 170，2021–2033（2013）。文章 CAS PubMed Google 学者 Jabeen, A., Kandadai, R. M., Kannikannan, M. A. & Borgohain, R. 运动障碍和痉挛症中的肉毒毒素使用指南。印度神经学年鉴 14，S31–S34（2011）。文章 PubMed PubMed Central Google 学者 Leippold, T., Reitz, A. & Schurch, B. 肉毒毒素作为排尿障碍的新治疗选择：当前技术的现状。欧洲泌尿科 44，165–174（2003）。文章 CAS PubMed Google 学者 Satriyasa, B. K. 肉毒毒素 (Botox) A 以减少面部皱纹的外观：临床使用和药理学方面的文献综述。临床美容调查皮肤病学 12，223–228（2019）。文章 CAS PubMed PubMed Central Google 学者 Zerner, B., Bond, R. P. M. & Bender, M. L. 动力学证据表明酰基酶中间体在 α-胸腺酶催化的特定底物水解中的形成。美国化学会杂志 86，3674–3679（1964）。文章 ADS CAS Google 学者 Bordwell, F. G. 二甲基亚砜溶液中的平衡酸性。化学研究记 21，456–463（1988）。文章 ADS CAS Google 学者 Nagy, N.等. 4-甲基伞形酮治疗和透明质酸抑制作为炎症、自身免疫和癌症的治疗策略。免疫学前沿 6，123（2015）。文章 PubMed PubMed Central Google 学者 Bailey-Darland, S., Krueger, T. D. & Fang, C. 溶液中硝基酚和硝基酚负离子的超快光谱：从电子动力学、振动结构到光化学和环境影响。分子 28，601（2023）。文章 CAS PubMed PubMed Central Google 学者 Mahesh, S., Tang, K.-C. & Raj, M. 生物分子的酰胺键活化。分子 23，E2615（2018）。文章 Google 学者 Watson, J. L.等. 使用 RFdiffusion 对蛋白质的结构和功能进行从头设计。自然 620，1089–1100（2023）。文章 ADS CAS PubMed PubMed Central Google 学者 Glögl, M.等. 目标条件扩散生成强效的 TNFR 超家族拮抗剂和激动剂。科学 386，1154–1161（2024）。文章 ADS PubMed PubMed Central Google 学者 Vázquez Torres, S.等. 从头设计的蛋白质中和致死性蛇毒毒素。自然 639，225–231（2025）。文章 ADS PubMed PubMed Central Google 学者