摘要 高质量的参考基因组是研究驼类染色体结构、环境适应和性状相关变异的重要工具。目前可用的双峰驼组装仍包含未解决的区域，特别是在富含重复序列和性染色体的部分。我们报告了Camelus.1.0，一个近乎完整的家养双峰驼（Camelus bactrianus）端粒至端粒（near-T2T）参考基因组，生成于来自中国内蒙古阿拉善的一只成年雄性驼。该组装通过整合PacBio HiFi读取（117.44 Gb；57.6×），Oxford Nanopore超长读取（231.42 Gb；113.4×），Hi-C读取（111.39 Gb；54.6×）和Illumina短读取（204.19 Gb；100.1×）构建。最终组装跨越2.46 Gb，由69个contig和60个scaffold组成，contig N50为71.57 Mb，scaffold N50为78.00 Mb。该组装包含七个缺口。Camelus.1.0包括家养双峰驼的第一个Y染色体组装，恢复了22个染色体两端的端粒重复序列和16个附加染色体一端的端粒重复序列，并识别了36个候选着丝粒区域。平均Merqury QV为56.21，BUSCO针对mammalia_odb12恢复了99.1%的完整直系同源基因，针对artiodactyla_odb12恢复了99.3%。我们总共注释了29,932个基因，包括20,149个蛋白编码基因，7,406个lncRNA基因，884个tRNA，791个snRNA，566个snoRNA，27个引导RNA和3个rRNA。重复元素占基因组的28.54%。该资源支持驼类比较基因组学、染色体生物学、种群分析、保护遗传学和分子育种。资助 本研究得到了上海交通大学“科技振兴内蒙古”专项项目（资助号：KJXM2023-02-01）的支持。作者信息 作者说明 这些作者贡献相同：刘佳佳，周浩。作者和机构 上海交通大学农业与生物学院，中国上海，200240，刘佳佳，周浩，张彩云，杨文浩，朱建申，秦超，王丽媛，朱文琦，黄金龙，马佩佩 & 孟赫；阿拉善盟畜牧业研究所，阿拉善盟，750306，中国，刘佳佳；巴彦淖尔农业与动物医学科学研究所，巴彦淖尔，015000，中国，周浩；内蒙古鹰歌素生物科技有限公司，巴彦淖尔，015995，中国，乌仁陶迪，王小山，张辉，陈泽明，艾东，邱盛宇，张文彬 & 刀乐马；阿拉善盟畜牧品种改良站，阿拉善盟，750306，中国，王云飞 & 陈秋娟；河套学院农业系，巴彦淖尔，015000，中国，王飞 & 李建军；上海交通大学内蒙古研究院，上海，200240，中国，伍尼孟赫；青岛农业大学动物科学与技术学院，青岛，266109，中国，张健 & 董志敏；中国水产科学研究院黄海水产研究所，青岛，266071，中国，张顺平 & 李艳辉；作者 刘佳佳，周浩，张彩云，杨文浩，乌仁陶迪，王小山，张辉，陈泽明，朱建申，秦超，王丽媛，王云飞，陈秋娟，王飞，李建军，伍尼孟赫，张健，董志敏，张顺平，李艳辉，朱文琦，黄金龙，艾东，邱盛宇，张文彬，马佩佩，刀乐马，孟赫；通讯作者 通讯请联系马佩佩、刀乐马或孟赫。伦理声明 竞争利益 作者声明没有竞争利益。附加信息 出版者声明 Springer Nature在已发布地图和机构隶属关系的管辖权声索方面保持中立。权利与许可 开放获取 本文章根据创意共享署名-非商业用途-相同方式共享4.0国际许可证进行许可，允许任何非商业用途、分享、分发和以任何介质或格式再生，前提是您给出原作者（们）和来源的适当致谢，提供创意共享许可的链接，指明您是否修改了许可材料。您没有权限根据此许可共享从本文章或其部分派生的改编材料。文章中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在材料的信用行中另有说明。如果材料未包含在文章的创意共享许可中且您的预期用途未被法律法规允许或超出允许用途，则您需要直接从版权持有人那里获得许可。要查看该许可证的副本，请访问 http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ 。有关此文章的引用：Jiajia, L., Hao, Z., Caiyun, Z.等。家养双峰驼（Camelus bactrianus）近乎完整的端粒至端粒参考基因组。Sci Data（2026）。https://d